Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya Baturraden

Retno Mayangsari; Agus Hery Susanto; Alice Yuniaty

Profil RAPD Tanaman Kantung Semar Beberapa Koleksi Kebun Raya Baturraden

Retno Mayangsari⁽¹⁾ , Agus Hery Susanto⁽²⁾

, Alice Yuniaty⁽³⁾

⁽¹⁾ Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman
⁽²⁾ Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman Purwokerto
⁽³⁾ Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman

Abstrak

Telah dilakukan penelitian tentang profil RAPD beberapa tanaman kantung semar (Nepenthes spp.) koleksi Kebun Raya Baturraden. Tujuh individu yang dipelajari merupakan spesies semiendemik Gunung Slamet dan endemik Jawa, yaitu N. adrianii dan N. gymnampora. Metode yang digunakan adalah survei dengan teknik pengambilan sampel secara acak. DNA genomik sampel diekstraksi untuk kemudian digunakan sebagai templat dalam amplifikasi marka RAPD menggunakan teknik PCR dengan 10 primer acak, yaitu ES10G23, ES10A26, ES10C24, ES10G33, OPA-2, OPA-9, OPA-13, OPB-3, OPB-5, dan OPB-7. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ke-10 primer tersebut menghasilkan 43 (67,2%) pita polimorfik dan 21 (32,8%) pita monomorfik dengan ukuran berkisar dari 130 hingga 1.500 bp. OPA-2 and OPB-3 menghasilkan polimorfisme tertinggi, sedangkan ES10G23 dan OPA-13 menghasilkan pita monomorfik terbanyak. Dendogram yang dikonstruksi menggunakan UPGMA dalam MEGA 6.06 memperlihatkan bahwa dua klaster terbentuk pada jarak genetik 18%. Kedua klaster tersebut cenderung dipisahkan oleh lokasi geografi.

Kata Kunci

kantung semar; RAPD; Kebun Raya Baturraden

Teks Lengkap:

PDF

Referensi

Azizah, E. 2015. Analisis Kekerabatan Beberapa Kultivar Ubi Jalar (Ipomoea batatas L.) berdasarkan Penanda RAPD. Skripsi. Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto.

Berita Negara Republik Indonesia Nomor 51 2008. Peraturan Menteri Kehutanan Nomor: P. 57/Menhut-II/2008 Tentang Arahan Strategis Konservasi Species Nasional 2008-2018.

Doyle, J.J. & Doyle, J.L. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 12(1): 13 – 15.

Karsinah, Sudarsono, Setyobudi, L. & Aswidinnoor, H. 2001. Keragaman genetik plasma nutfah jeruk berdasarkan analisis penanda RAPD. Jurnal Bioteknologi Pertanian 7(1): 8 – 16.

Nandariyah. 2010. Morphology and RAPS (Random Amplified Polymorphic DNA) based classification of genetik variability of Java salacca (Salacca zalazza Gaertner. Voss). Journal of Biotechnology and Biodiversity 1(1): 8 – 13.

Nei, M. & Li, W. 1987. Estimation of average heterozygosity and genetik distance from a small number of individual. Genetics 89: 583 – 590.

Nurhidayati, R,W. 2016. Keragaman Genetik Kultivar Duku (Lansium parasiyicum) K.C. Sahni & Bennet) di Purbalingga berdasarkan Penanda RAPD. Skripsi. Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto.

Puspitaningtyas, D.M. & Wawangningrum, H. 2007. Keragaman Nepenthes di suaka alam Sulasih Talang-Sumatera Barat. Biodiversitas 8(2): 152 – 156.

Rout, G R., Bhatacharya, D., Nanda, R M., Nayak, S., & Das, P. 2003. Evaluation of genetic relationship in Dalbergia species using RAPD markers. Bioconservation 12: 197 – 206.

Song, B.K., Clyde, M.M., Wickneswari, R, & Norman, M.N. 2000. Genetic relatedness among Lansium domesticum accessions using RAPD markers. Annals of Botany 8: 299 – 307.

Williams, J.G.K., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalski, J.A., & Tingey, S.V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleid Acids Research 18: 125 – 130.